Evil Diary è ambientato in un 1997 alternativo in cui, tre anni prima, gli alieni attaccarono il pianeta, riducendo New York in rovina. Persone e animali furono trasformati in creature orribili e assetate di sangue. Il giocatore prende il controllo di Eve, una dei pochi sopravvissuti, che è determinata a fuggire dalla città e cercare rifugio in una zona sicura all'esterno, mentre viaggia, combattendo i mostri e cercando di sopravvivere.
